徐光启听到皇帝的这个命令后，心中很是激动。他是信徒不假，但也同样是儒者，学习西学的目的，是以西学补儒学。因此他对于传播教化，还是很热心的。
耶稣会中国教团被改造为景教会后，他心中的信仰危机得到缓解。这让他的一些想法，更加坚定起来。
在汤若望等人离开后，徐光启向皇帝请求道：
“陛下，陕西五月以来，一直没有下雨。”
“禾苗尽皆干枯，这一季确定要绝收。”
“臣请前往陕西，应对此次旱灾。”
这是他近两个月一直在思考的事，也是在确认皇帝的说法后做出的选择。
在他看来，这次旱灾的原因，既然和传教士有关，自己作为信徒，就应该主动赎罪。
朱由检对他这个想法，不知说什么好。他给出的旱灾理由主要是甩锅，避免以后旱灾频繁发生时，自己被大臣逼着下罪己诏。
给徐光启带来这么大的痛苦，是他没想到的。
对徐光启救灾的想法很赞赏，朱由检却否决了他前往陕西的事情，说道：
“救灾不一定要去陕西，那边朕已经安排了陈奇瑜去查看。”
“徐卿身在朝中，应该知道对于朝廷来说，练好新军最重要。”
“这样才能在以后和建虏决战，夺回辽东安置灾民。”
“徐卿刚刚把新军士兵选好，这时不能离开。”
徐光启道：
“新军训练，可交给孙元化……”
提到这个，徐光启方才想起，自己把孙元化推荐为出使泰西的使臣。
这下新军的事务，他还真离不开。
朱由检也想到了这点，说道：